Inazuma Eleven — Inazuma Eleven GO Chrono Stone

Trois mois se sont écoulés depuis la finale du tournoi de la Route du Sacre, les vacances sont terminées, et une nouvelle année scolaire commence à Raimon. Mais pour Arion, cette journée va vite virer au cauchemar.

Arion rencontre Wunderbar, qui se présente à lui dans la caravane d'Inazuma. Avec Fei, qui vient de créer plusieurs doubles, ils forment l'équipe des Sherwinds pour affronter leur adversaire, l'équipe du Protocole Oméga dirigée par Alpha.

Les Sherwind sont toujours en plein match contre le Protocole Oméga, dans un espace temps différent du notre.

Dans l’un des mondes parallèles, Victor semble s’être désintéressé du foot. Vladimir, Arion et leurs amis reviennent dans le passé, afin d’empêcher Alpha de procéder à une déviation spatio-temporelle dans le cours de l’histoire de Vladimir et Victor.

Une loi qui interdit le football vient de passer et le club de Raimon doit fermer. La cause de cette loi a vraisemblablement été le match amical entre le Japon et les Etats-Unis qui s’est tenu un mois plus tôt.

Le match entre les Etats-Unis et le Japon continue. Raimon joue sous les couleurs américaines, Beta et les duplicants du Protocole Oméga jouent pour le Japon. Le match est d'une violence hors norme.

Le football est interdit mais les joueurs du collège Raimon veulent tout de même s'entraîner pour empêcher la disparition de leur sport préféré.

Grâce à l'intervention de Tezcat en plein match, l'équipe de Raimon évite la défaite face au protocole Oméga 2.0. Arion et l'équipe de Raimon se retrouvent sur l'île de Tezcat qui leur propose de les aider à maîtriser leur armure d'esprit guerrier.

Raimon voit avec désolation le football disparaître petit à petit. Ils décident de faire un bond de 200 ans dans le futur pour voler "Les Enseignements du Maître" dans le Musée du Football. Ce livre a été écrit par le Maître, un génie du football.

Étant donné que l'identité du mystérieux maître est inconnue, nos héros ne peuvent le retrouver pour lui demander en personne. Alors qu'ils commencent à désespérer, Silvia et Celia leur apportent un indice.

L'équipe de Raimon a retrouvé David Evans, le grand-père de Mark Evans. Il s'occupe de prendre l'équipe en main en développant la technique 3D.

Arion et toute l'équipe se retrouve dans le Japon féodal à la recherche de Nobugana Oda. Pour David, l'aura de ce dernier doit être intégrée à celle de Riccardo di Riggo pour le rendre plus fort.

Le match entre la bande du Cerf Blanc, contrôlée mentalement par Beta, et l’équipe de Raimon, complétée par Tasuké et ses amis, commence. Les joueurs adverses dominent le début de la rencontre.

Arion, Wunderbar, et les autres mettent au point un stratagème pour capter l’attention de Nobunaga. L’idée est de s’infiltrer dans la fête des fleurs à laquelle il assistera et de se faire passer pour une troupe de danseurs.

Par l'intermédiaire de ses vassaux, c'est-à-dire Beta et ses camarades du Protocole Oméga, Imagawa provoque Nobunaga en duel et veut l'affronter lors d'une "bataille de Kemari".

Le match commence enfin, sous l’oeil attentif de Nobunaga Oda et de Yoshimoto Imagawa. Arion et ses amis font de leur mieux pour représenter Nobunaga, grâce aussi à l’aide de Tasuke et de ses amis. Mais la différence de niveau est flagrante.

L'équipe de Raimon, entrainée par Nobunaga Oda, affronte celle d'Imagawa. Nobunaga, après avoir analysé le jeu de Riccardo, lui conseille afin d'être plus efficace, d'essayer de se déplacer sans qu'on le remarque.

L'équipe du collège Raimon est enfin de retour dans la ligne temporelle présente après son long séjour dans le monde féodal. Ils sont heureux d'avoir franchi la première étape.

Arion et ses amis arrivent en 1427 en pleine guerre entre français et anglais. Soupçonnés d’être des espions anglais, ils sont emmenés au village de Vaucouleurs.

Jeanne d’Arc a entendu la voix de Dieu lui demandant de sauver la France en guerre depuis si longtemps. Arion et son équipe voyagent avec elle et vont demander des renforts au dauphin Charles pour défendre Orléans.

Raimon affronte les joueurs du protocole Oméga 3.0 dans un match très disputé. La stratégie de Charles a du mal à passer parmi les joueurs de Raimon qui sont épuisés et commence également à énerver les joueurs de l'équipe adverse.

JP a du mal à progresser en tant que gardien de but. C'est pourquoi David leur propose de faire un saut temporel de 1800 ans. Dans la Chine Antique, nos héros devront rencontrer Liu Bei et Zhuge Liang.

Après avoir remporté le duel contre Zanark, Arion et ses amis continuent leur chemin, mais la forteresse de Zhuge Liang leur réserve bien d’autres surprises. Chaque pièce cache un piège qu’il leur faut parvenir à déjouer.

Alors qu’Arion et ses amis rencontrent Zhuge Liang et tentent de la persuader d’aider Liu Bei à empêcher Cao Cao de nuire, Zanark Avalonic fait son apparition.

Zhuge Liang et Sol Daystar réalisent un Miximax pour lutter contre Zanark Domination, qui leur réserve bien des surprises. Le match commence à devenir trop violent, même JP est terrorisé par les tirs de Zanark qu'il ne peut pas arrêter.

L'équipe de Raimon fait un voyage dans le Kyoto de 1867 pour retrouver Soji Okita et Ryoma Sakamoto, deux samouraïs. L'équipe se sépare en deux, Jade et Ryoma prennent chacun la tête d'une équipe.

Celui avec qui nos héros se sont liés d’amitié s’avère être Ryoma Sakamoto, l’homme qu’ils cherchaient. Ryoma les croit lorsqu’ils lui disent qu’ils viennent du futur pour lui demander son aide et sauver le football.

Takamoto sollicite une audience auprès du Shogun mais les gardes du chateau Nijo l'empêchent d'entrer, il parvient tout de même à prendre la fuite en détournant leur attention.

Raimon et Domaine Zanark s'affrontent pour gagner le match. L'équipe de Raimon commence très mal son match.

Avec le soutien de Wunderbar, Arion et Fei s’entraînent dur pour coordonner leur attaque dans l’espoir de créer une nouvelle super technique. Mais Arion ne peut s’empêcher de repenser à Mark Evans.

Arion et ses amis se retrouvent à remonter le temps jusqu’à l’ère des dinosaures à la recherche du fameux dinosaure. C’est là, dans ce monde hostile, qu’ils font faire une rencontre inattendue.

Menés par le jeune Sor, nos héros trouvent Big Mama, un dinosaure très puissant. Sor est fasciné par le football et demande aux joueurs de Raimon de l'entraîner.

L'équipe Excellence tente de prendre le contrôle mental de l'équipe de Raimon mais en est empêchée par le Professeur Cryptix. Nos héros ne s'avouent pas vaincus et décident de reprendre l'entraînement pour pouvoir battre l'équipe Excellence.

Raimon est en plein match contre l'équipe Excellence et ça se passe très mal. Les robots sont beaucoup trop forts pour eux. Goldie pousse alors Fei à se surpasser.

L’équipe de Raimon continue de rassembler les différents pouvoirs nécessaires à la meilleure équipe de l’histoire.

Arion découvre que Riccardo fait partie des Chevaliers de la Table Ronde. Pour en faire également partie, il doit se plier à une épreuve d'intégration.

Menés par le Roi Arthur, les Chevaliers de la Table Ronde se mettent en route pour la Grotte de la Désolation afin de secourir Goldie, prisonnière du Chevalier Noir et de la Reine des Dragons.

Le mystérieux Chevalier Noir qui a pris le contrôle de la Reine des Dragon et l’a endoctrinée, n’est autre que Ar Ecks, capitaine de l’équipe Excellence.

L'équipe de Raimon est téléportée au quartier général d'El Dorado. Après avoir découvert les plans de la génération de la seconde phase, ils décident d'unir leurs forces à celles d'El Dorado.

Siméon n'est autre que le leader de la Nu-Gen ! Il a détruit le bâtiment d'El Dorado avec ses camarades de la Génération de la Seconde Phase et reconstruit un stade pour Ragnarök, l'ultime tournoi.

Le match Eldorado / équipe Zan continue. En plus, surprise de taille : On découvre que Fei était en fait un Nu-Gen, dont Siméon a effacé la mémoire afin de l'envoyer auprès de Raimon pour les infiltrer.

Le deuxième match du tournoi Ragnarök est sur le point de commencer et va voir s’affronter Gihl, la deuxième équipe de la Nu Gen, et Eldorado 2, une équipe réunissant des joueurs du Protocole Omega et de Raimon.

L'équipe Gilh affronte Eldorado 2, dans un match sans concession. Gihl mène 3 à 0. La situation est critique. Si Eldorado 2 perd ce match, le tournoi de Ragnarök sera définitivement terminé.

C'est le troisième match de Ragnarök entre Eldorado 3 et l'équipe Gahl. Arion s'inquiète pour Fei qui est passé dans le camp adverse, il veut lui ouvrir les yeux.

Alors que l’équipe Eldorado 3 affronte Gahl dont Fei fait partie dans le troisième match du tournoi Ragnarök, Zanark surgit et demande à intégrer l’équipe car il peut prouver que c’est bien lui le onzième joueur de l’équipe ultime.

Zanark Ultra marque un but. Les deux équipes sont maintenant à égalité. Mais Fei, sous l'influence de Siméon, met en ouvre ses pouvoirs. Pour empêcher l'équipe Eldorado 3 de jouer, il émet des ondes télékinétiques.

Fei se laisse convaincre par les paroles d'Arion pour se joindre de nouveau à eux : l'équipe ultime est enfin au complet, prête à reconquérir le football ! Il manque seulement Mark Evans.

Mark Evans reprend sa forme d'être humain. Toute l'équipe Chrono Storm lui demande d'être le coach du Match Ultime. Il accepte. Mais c'est sans compter les pouvoirs de Siméon, Capitaine de l'équipe Ragnah de la Nu-Gen.

Le match opposant l’équipe Chrono Storm à l’équipe Ragnah se poursuit et cette dernière continue sa démonstration de force.

Chrono Storm gagne le match contre Ragna 5-4. Fey, Goldie, Sor et Zanark retournèrent à leurs époques respectives après que Raimon est revenu à son époque.

Arion, JP et Skie se souviennent de leurs aventures dans le futur et racontent les moments forts à Silvia.